墨水的褪色問題是跟使用環境是有關系的，染料類型的墨水是色彩還原度比較高的，但染料油墨在抗氧化、防水性能等方面都遠不如顏料墨水。當染料油墨在經過長期自然空氣環境中保存后，都會發生一系列氧化反應，從而使墨水產生褪色、溶解等問題。而顏料墨水則不會出現此類問題。

這兩種墨水的差異區別正是由于其結構的不同，染料墨水中的主要染料著色成分是由分子級全溶解的墨水組成，著色的物質顆粒十分細小，且染料油墨易溶解于水溶液或者其他化學溶劑，所以油墨遇水就會使得原本的內容產生溶解擴散，并造成嚴重的暈染現象。如果是長期暴露在空氣中、太陽光下等環境中，就會造成染料的著色劑化學鏈的斷裂，油墨就開始褪色溶解。染料墨水的屬性決定了它是不易堵塞噴頭的，對于精密墨盒中的墨水來說，更高的流暢性也是至關重要的。

顏料墨水的成分是由一些納米級的細小顆粒物質組成的，這些顆粒物質要比在染料中的墨水分子大許多。為了保證其墨水出墨的最佳流暢性，大部分直徑在40-125納米之間。由于顏料油墨的著色劑并不溶解于水，所以在遇到水后，顏料油墨不會發生溶解和擴散的現象，而且著色劑的外層是有樹脂層的，即使是長期的光照環境，內部的著色劑依舊不會被輕易破壞，油墨也就不易產生褪色等問題。