控制器是防偽噴印系統的數據運算中心，是重要部件。

每臺控制器至多可控制 2 英寸寬度噴頭的噴印。 如 4 個 0.5 英寸噴頭。

控制器的正面有電源開關、30V電源插口、信號輸入口、RJ45網口、狀態指示燈。控制器的反面有4個HDMI口，可以同時連接4個噴頭。

主機控制器能將電腦端的Logo圖案模板傳輸到打印端，安裝帶有墨盒的鋁制墨水匣開始打印輸出圖案或者圖形。